Cursos de Genómica microbiana en Cali

La genómica y la metagenómica microbianas combinan tecnologías de secuenciación avanzadas con análisis computacional para caracterizar comunidades microbianas, analizar genomas y detectar rasgos funcionales como la resistencia a los antimicrobianos.

Este curso, dirigido por instructores tanto en línea como presencialmente, está diseñado para investigadores y bioinformáticos de nivel principiante a intermedio que buscan realizar análisis práctico de datos de secuenciación genómica y metagenómica microbianas.

Al finalizar este curso, los participantes serán capaces de:

• Describir flujos de trabajo de secuenciación comunes y formatos de archivo clave utilizados en la genómica microbiana.
• Ejecutar el control de calidad y preprocesamiento de lecturas NGS crudas.
• Realizar perfiles taxonómicos utilizando enfoques basados en marcadores y k-meros.
• Ensamblar y anotar genomas microbianos y plásmidos.
• Detectar SNPs, construir filogenias e interpretar la estructura poblacional.
• Predeterminar genes de resistencia antimicrobiana y resumir perfiles funcionales.
• Utilizar flujos de trabajo reproducibles con Conda, Docker e informes basados en cuadernos.

Formato del curso

• Lecciones que introducen conceptos y herramientas (20%).
• Sesiones prácticas con conjuntos de datos de ejemplo (60%).
• Discusiones abiertas y análisis guiados para que los participantes puedan aplicar métodos a sus propios datos (20%).

Opciones de personalización del curso

• Para solicitar un taller personalizado enfocado en metagenómica clínica, ambiental o industrial, por favor contáctenos para hacer los arreglos necesarios.